Final Fantasy Explorers ne déroge pas à la règle Square-Enixienne et aura droit à sa version collector japonaise. D'un montant de 13000 yens (environ 95 euros), cette "Ultimate Box" contiendra :

- Le jeu,
- Un artbook 'Ultimate Box Explorers Art Works' qui va contenir les illustrations du trio Yoshitaka Amano / Toshiyuki Itahana / Gen Kobayashi,
- Un CD 'Suppin Tracks' qui va contenir quelques démos expérimentales utilisées dans la conception de l'OST du jeu, avec en bonus un livret expliquant comment Tsuyoshi Sekito a procédé pour composer,
- Une protection en plastique dur pour la 3DS XL, protection avec une illustration d'Amano dessus,
- Une pochette de rangement pour la 3DS XL,
- Le tout dans une boite collector format A4, avec encore une fois une illustration d'Amano.